As galerias ripícolas actuam como filtro biológico ainda através da desnitrificação levada a cabo pelas bactérias desnitrificantes, em condições de anaerobiose, e através da retenção microbiana. As zonas localizadas em torno das raízes, a rizosfera, suportam elevada biomassa de microorganismos capazes de degradar, com grande eficiência, herbicidas, insecticidas, entre outros compostos.
Estes sistemas actuam também como barreiras lineares entre as superfícies terrestres e aquáticas, estabilizando as margens, o que reduz a erosão provocada pelo curso de água, e retendo os sedimentos resultantes da erosão hídrica em zonas adjacentes, que para além de evitar a deposição dos sedimentos no sistema aquático com todas as sua implicações, reduz a mobilização de nutrientes que estão associados às partículas sedimentares.